בפנמה האקלים הוא טרופי וחם לאורך כל ימות השנה. ההבדלים העיקריים המורגשים לאורך השנה הם ההבדלים בכמויות הגשמים שיורדות באזורים השונים של המדינה, במהלך עונות השנה השונות.
עונות השנה בפנמה מתחלקות לשתי עונות מרכזיות:
1. בין החודשים מאי עד נובמבר, זוהי העונה הגשומה, בה ניתן לראות כמויות משקעים גדולות יותר.
2. העונה השנייה של השנה היא העונה היבשה, אשר מתרחשת בין החודשים דצמבר לאפריל מידי שנה.
הגשם הוא מופע שכיח בשמיים של פנמה, לאורך כל עונות השנה.
